گنبد مطلای امام علی(ع) با گذشت بیش از سه قرن از ساخت آن به دست ایرانیان، بر اثر عوامل مختلف، دچار فرسایش و خوردگی شده و نیازمند ترمیم و مرمت بود که پیرو توافق به عمل آمده با دیوان وقف شیعی عراق و تولیت حرم مطهر علوی، مقرر شد، گنبد مطلای حرم آن امام همام توسط ستاد بازسازی عتبات عالیات مجدداً طلاکاری و نوسازی شود.
به همین منظور با مدیریت واحد صنعتی و هنری ستاد بازسازی عتبات عالیات، کارگاههای مرمت و بازسازی خشتهای قدیمی و آبکاری جهت اضافه کردن طلا روی خشتها و نصب مجدد آنها بر روی گنبد راه اندازی و تجهیز شد.
با توجه به ارزش تاریخی خشتهای گنبد، مقرر شد تا خشتهای قدیمی پس از ترمیم و صافکاری مجددا آبکاری شده و به پوشش طلای آنها، ۱۷ میکرون افزوده شود. زمان اجرای این قرارداد به مدت ۱۸ ماه پیش بینی شده و ستاد بازسازی عتبات عالیات استان خوزستان مسئولیت اجرای آن را به عهده گرفته است.
مساحت گنبد حرم امام علی(ع)،۶۵۰ متر مربع است که ۱۰ هزار خشت طلا دارد و طلای مورد نیاز برای تعمیر گنبد از محل وقف تامین میشود.